色谱柱在使用中最常见的问题就是柱压升高，如果柱压是在长时间使用过程中缓慢增加，属于正常现象。但柱压在使用过程中突然升高(系统管路堵塞及压力传感器故障除外)，可能的原因有如下几点：

( 1 )色谱柱头的过滤筛板堵塞或污染；

( 2 )色谱柱头的填料被样品污染;；

( 3 )色谱柱内缓冲液中的盐遇到高浓度的甲醇或其他有机溶剂，形成结晶析出；

( 4 )流动相 PH 值过大或过小使固定相结构破坏或溶解。 

解决办法如下： 

( 1 )如确定是色谱柱头的过滤筛板被污染，可以将色谱柱反方向用甲醇冲洗至正常压力，或者卸下色谱柱头，将其放在 10 %的稀硝酸内超声清洗 10 分钟，后再用纯水超声 10 分钟，重新装入色谱柱；

( 2 )如确定色谱柱头的填料被污染，将柱头螺丝卸下，挖出柱内前段被污染的填料，用相同的柱填料重新填入，仔细修复后，重新安装上柱头螺丝；

( 3 )如确定定是盐结晶，用 10% 的甲醇 / 水冲洗色谱柱使柱内盐全部溶解，再换高浓度甲醇； 

( 4 )如果因 PH 值使用不当，很难恢复。